馬鈴薯晚疫病是嚴重威脅糧食安全的重大病害,至今每年仍造成近百億美元經(jīng)濟損失。由于晚疫病病原菌致病疫霉菌變異迅速,現(xiàn)有抗病基因在育種中逐漸失效,亟需挖掘新型抗性基因資源和革新抗病育種策略。記者4日從南京農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,該校植物保護學(xué)院教授董莎萌課題組聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員黃三文團隊構(gòu)建出目前植物界規(guī)模最大的抗病基因資源庫,成功克隆了三個新型抗晚疫病基因,提出了基因“插件式”抗病育種新策略。相關(guān)成果近日刊發(fā)于《自然》。

“馬鈴薯在生產(chǎn)過程中,長期受晚疫病影響。盡管科學(xué)家已從馬鈴薯野生種中克隆出近30個抗晚疫病基因,但多數(shù)已被病原菌‘破防’?!闭撐墓餐ㄓ嵶髡叨日f。
此次研究中,科研團隊選取7個高抗晚疫病的野生馬鈴薯種質(zhì),采用第三代高保真測序技術(shù)完成高質(zhì)量基因組組裝,注釋基因完整性高達94.6%—98.3%。
“結(jié)合已公開的基因組數(shù)據(jù),團隊構(gòu)建了含39211個胞內(nèi)抗病受體基因的馬鈴薯泛抗病基因組,這是目前植物界規(guī)模最大、覆蓋最全的抗病基因資源庫?!倍日f。
研究進一步將抗病基因劃分為兩大類:一類基因拷貝數(shù)多、變異快,主要識別卵菌、線蟲等快速進化病原;另一類基因保守且數(shù)量少,多作為“輔助蛋白”參與免疫信號傳遞。
“基于泛抗病基因組資源,我們成功克隆了三個新型抗晚疫病基因。這些抗病新基因為通過常規(guī)育種手段精準(zhǔn)設(shè)計晚疫病抗性提供了資源支撐?!闭撐牡谝蛔髡摺⒅袊r(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所副研究員王路遙說。
更具突破性的是,團隊提出“結(jié)構(gòu)域插件”育種策略:將野生馬鈴薯S.burkartii中發(fā)現(xiàn)的抗晚疫病基因的重金屬結(jié)合相關(guān)結(jié)構(gòu)域“嫁接”到已失效的晚疫病抗病基因R1的末端,使R1同時識別病原物分泌蛋白AVR1與AVRbrk1,這成功拓展了R1基因的抗病譜。
“這種‘即插即用’的基因設(shè)計思路,為快速創(chuàng)制廣譜抗病品種提供了全新路徑?!倍日J為,此項研究不僅構(gòu)建了高質(zhì)量的抗病基因資源庫,建立了作物抗病基因挖掘的基因組學(xué)范式,更創(chuàng)新性地提出具有前瞻意義的育種策略,有望為全球糧食安全提供理論與技術(shù)支撐。
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